Data AOPK

Agentura Ochrany Přírody a Krajiny ČR (AOPK ČR) poskytuje různá data týkající se ochrany přírody (oblasti chráněných území, VMB - vrstva mapování biotopů , nálezy organismů) v různé podobě (souborové formáty, webové služby - WMS,WFS, …). Obecné informace k získávání a poskytování dat můžeme nalézt na Portálu informačního systému ochrany přírody (Portál ISOP). Obecně jsou data poskytována ve třech úrovních a to jako otevřená data, otevřená data po registraci, a data poskytovaná na základě žádosti (smlouvy).

Jako rozcestník k získání dat můžeme použít stránky https://data.nature.cz/. Ke každé datové sadě je zde základní popis, licenční podmínky, odkaz ke stažení dat popř. na webovou službu.

../../_images/data_nature.png

Obr. 239 Přehled dostupných dat AOPK na https://data.nature.cz/

V případě, že datová sada vyžaduje registraci, odkaz stažení dat Vás přesměřuje na přihlášení do ISOP (pokud již nejste přihlášení). Pokud nemáte zaregistrovaný účet můžete použít odkaz Založit nový účet v informačním systému AOPK ČR přímo z přihlašovacího formuláře.

../../_images/login.png

Obr. 240 Přihlašovací formulář ISOP

V současné době je nutná registrace u datových sad Aktualizace základního mapování biotopů a Nálezová databáze ochrany přírody.

../../_images/registrace.png

Obr. 241 Registrační formulář

Nálezová databáze ochrany přírody

Nálezová databáze ochrany přírody je databáze nálezů organismů, které jsou lokalizované v čase a prostoru. Od roku 2017 je databáze, s výjimkou citlivých nálezů chráněných druhů, plně dostupná veřejnosti, nutné je pouze se zaregistrovat. Přístup do nálezové databáze ochrany přírody je umožněn prostřednictvím aplikce Filtr nálezových dat. Pokud potřebujeme přístup ke všem druhům bez výjimky, lze požádat o plný přístup. Ten je potom poskytován na základě smlouvy.

../../_images/nd_uvod.png

Obr. 242 Úvodní stránka nálezové databáze

Databáze obsahuje údaje z různorodých zdrojů. Jsou zde uvedeny záznamy z vědeckých publikací, informace z odborných pracovišť, výsledky projektů zaměřených na mapování a monitoring, importovaná data (Fytocenologická databáze , AVIF, …), data z inventarizačních průzkumů, historické záznamy, náhodná pozorování, citizen science - data od veřejnosti (aplikace BioLog). Zastoupení jednotlivých zdrojů lze prohlížet ve statistikách na stránkách ISOP. Každý rok zde přibývá přibližně 1 až 1.5 milionu nových záznamů.

NDOP Downloader

Pro stažení nálezových dat přímo v QGIS můžeme použít zásuvný modul NDOP Downloader ndop_downloader. Tento zásuvný modul lze nainstalovat pomocí menu Zásuvné moduly –> Spravovat a instalovat zásuvné moduly. První je nutné povolit experimentální zásuvné moduly. V záložce nastavení zaškrtneme políčko Zobrazit také experimentální zásuvné moduly.

Po zadání přihlašovacích údajů lze stáhnout nálezy podle zadaného taxonu nebo oblasti (KÚ,ZCHÚ). Pokud zaškrtnete položku Uložit přihlašovací údaje, údaje se uloží do konfiguračního souboru .ndop.cfg v domovském adresáři.

../../_images/ndop_downloader.png

Obr. 243 Okno NDOP Downloaderu v QGIS

Výstupem jsou dostupná data lokalizací (.shp komprimované v .zip) a tabulková data (.csv) pro všechny záznamy. Lokalizace se po ukončení stahování nahrají do projektu. Tabulková data se nahrají do projektu jako Oddělený text a zobrazí se jako body (na základě souřadnic v tabulce). Tato data obsahují body a centroidy většiny polygonů a linií.

Parametry:

  • Taxon - Lze vybrat pomocí rolovací nabídky, nebo vepsáním názvu s funkcí našeptávače. Lze zadávat česká i latinská jména.

  • Region - Obdobně jako u taxonu. V případě že položka zůstane nevyplněná, získáme data z clého území ČR. Naopak, pokud vybyreme území regionu a necháme prázdné políčko taxonu, získáme data všech taxonů ve vybraném regionu.

  • Výstupní složka - Vybereme výsupní složku kam se nám data uloží. Pokud ponecháme prázdné, stáhnou se data do složky dočasných souborů. V případě, že nechceme stahovat tabulková data zaškrtneme možnost Nestahovat tabulková data. Stažené soubory se nahrají do projektu a ponesou název odvozený od použitého filtru a typu dat. Pokud je do filtru zadán taxon, bude název odvozen od názvu druhu (např. Mantis_religiosa_shp_b - bodová vrstva (.shp)). Poukd filtrujeme pouze podle regionu bude název odvozen od názvu regionu.

Po potvrzení tlačítkem Ok se okno zavře a spustí se filtrace a stahování. QGIS během stahování nelze v současné době používat. Stejně jako při použití oficiálního webové filtru, stahování může trvat několik minut, v závislosti na počtu záznamů, stažení tabulkových dat atd.

V informačním panelu v horní části obrazovky uvidíte informace o průběhu stahování. Při stahování se také vypíše počet záznamů a hrubý odhad doby trvání konkrétního kroku. Po úspěšném stažení se objeví zelený panel s odkazem na složku kam byla data stažena.

../../_images/ndop_result.png

Obr. 244 Data stažené pomocí zásuvného modulu NDOP Downloader

Webový filtr nálezových dat

Základní způsob jak stahovat data z nálezové databáze je použití webového filtru přímo na stránkách Nálezová databáze ochrany přírody AOPK. Na úvodní stránce nálezové databáze lze zadat název druhu, a po zadání vyhledání nás stránka přesměřuje na Filtr nálezových dat, kde můžeme data filtrovat na základě více parametrů např: autora nálezu, datumu/období, území (katastry, CHÚ, síťové mapování, …), ručně zakresleného území v mapě (max. 25km:sup:2) , kategorie ochrany, …

../../_images/filtr.png

Obr. 245 Filtr nálezových dat veřejného přístupu

Po zadání parametrů pro filtrování stiskneme tlačítko Filtrovat. Výsledky filtru se nám vypíší jako jednotlivé záznamy, ve formě tabulky. Zde uvidíme základní a nejdůležitější informace o nálezu (co? - kde? - kdy? - kdo?). Výsledky je také možné zobrazit v mapě nebo síťové mapě, popř. pokud jsme nefiltrovaly na základě druhů lze využít Sumarizace výsledků podle druhů.

../../_images/priklad_filtr.png

Obr. 246 Příklad filtrování druhu Mantis religiosa

Ve výpisu výsledků lze otevřít Kartu nálezu - podrobné informace o konkrétním nálezu, Kartu akce - podrobné informace o mapovací akci, zobrazit konkrétní nález v mapě (Mapa) nebo otevřít Kartu druhu, kde jsou shrnuty informace o konkrétním druhu.

Karta nálezu - data o nálezu

U každého nálezu je k dispozici mnoho údajů:

  • ID nálezu

  • CO - informace o druhu - název druhu, taxonomické zařazení, ochrana; doplňující informace - počet, druh pozorování, poznámky

  • KDE - území, souřadnice (v případě území - centroid), typ zákresu, id lokalizace

  • KDY - datum, id akce

  • KDO - autor

  • zdroj dat - projekt, datová sada

  • věrohodnost, validace - lze zpochybnit

  • mapa zákresu, popř. fotografie

../../_images/karta_nalezu.png

Obr. 247 Karta konkrétního nálezu

Ve spodní části výpisu filtru máme možnost exportu tabulkových dat (CSV, XML, HTML, TXT) i lokalizace nálezů (SHP):

  • tabulková data - lze exportovat i souřadnice centroidů, ty následně

zorbazit v QGIS jako body

  • Stránka - export informací o nálezech na dané stránce

  • Vše - export informací o všech naálezech (omezeno na prvních 1000

nálezů)

  • Lokalizace - export lokalizací nálezů v .shp, obsahuje pouze atribut

id_lokalizace - po stažení lze spárovat s exportovanými tabulkami

../../_images/export.png

Obr. 248 Možnost exportu ve filtru nálezů

../../_images/export_tab.png

Obr. 249 Export tavulkových dat výsledku filtru